El Consejo Facultativo es el máximo es el máximo órgano de gobierno de la Facultad de Ciencias e Ingeniería, lo integran 22 miembros, presidido por el MSc. Marlon Leonel Díaz Zúniga.
| Marlon Leonel Díaz Zúniga | Decano | Decanato |
| Hellen Parrales Cano | Vicedecana | Decanato |
| Alina María Ortiz | Secretaria | Decanato |
| Frank Medrano Mayorga | Profesor Titular Propietario A | Departamento de Química |
| Marythel Garache Zamora | Profesor Titular Propietaria B | Departamento de Construcción |
| Xochilth Zambrana Áreas | Profesor Titular Suplente A | Departamento de Tecnología |
| José David Quiroz | Profesor Titular Suplente B | Departamento de Biología |
| Santiago Ríos Baca | SIPDES-ATD | Departamento de Computación |
| Jairo González Moreno | SIPDES-ATD | Departamento de Tecnología |
| Carlos Méndez | SITRA-Seccional | Administración |
| Jhowin Alberto Silva Mairena | Presidente UNEN | UNEN |
| Rubén Alfonso Alvarado | Vicepresidente UNEN | UNEN |
| Noel Zelaya Vanegas | Director | Departamento de Física |
| Danilo Avendaño | Director | Departamento de Computación |
| Ana Marcela Abea Pérez | Directora | Departamento de Matemática y Estadística |
| Elim Campos Pérez | Director | Departamento de Tecnología |
| Freddy Sánchez Ruiz | Director | Departamento de Construcción |
| Norma Roas Zúniga | Director | LAF-RAM |
| Roger Jaime Manzanares | Coordinador | Internacionalización |
| Maycol Salazar | Coordinador | Innovación |
| Andrea Marcela Castillo | Coordinadora | Investigación |
| Sara Negaresh | Coordinadora | Posgrado |
